生物信息学

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服务介绍

基因表达谱测序    

       基因表达谱测序,利用RNA-seq测序技术,实现对某一物种在特定生物过程中基因表达情况的研究。通过高通量测序技术,一次测序可得到1000万条以上的序列,具有很好的随机性分布,可以准确地定量基因表达,重复性好,无需重复性验证。该产品已经被广泛应用于基础科学研究,医学研究和药物研发等领域。

      基因表达谱测序用来研究基因表达的情况,主要在基因表达量分析、基因表达差异分析,以及差异基因模式和功能聚类等方面应用广泛。

      沃登拥有最熟练的基因表达谱测序技术:1.通量高:一次测序得到1000万条以上的序列;2.数字化信号:测序直接获得序列,无背景噪音,可鉴别序列间单个碱基差异;3.检测阈值广:跨越6个数量级的宽检测阈值,从几个到数十万个拷贝精确计数;4.定量更准确:使用多种统计学方法计算基因表达水平;5.良好的重复性:深度测序保证了抽样的随机性,重复性非常好,无需技术重复。

服务内容

1.RNA抽提及测序

2.标准信息分析:

    1). 对原始数据进行去除接头序列及低质量reads的处理;

    2). 测序评估(数据比对统计,测序饱和度分析,测序随机性的统计分析,reads在参考基因上的分布分析);

    3). 基因表达注释;

    4). 差异表达基因分析(差异表达基因筛选,实验重复性分析,两个或两个以上样品);

    5). 差异基因表达模式聚类分析(需要确定对符合哪些条件的差异表达基因做聚类分析);

    6). GO功能显著性富集分析;

    7). GO功能分类分析(WEGO分析);

    8). Pathway显著性富集分析;

    9). 蛋白互作网络分析(人和小鼠)。

3.个性化信息分析(≥5个样品):

    1).条件特异表达分析(适用于真核生物);

    2).主成分分析。

服务说明

      1.样品类型:细胞、新鲜组织或RNA样品;

      2.样品需求量:细胞样品≥1×107个,动物组织≥1 g,植物组织≥2 g,RNA≥10 μg;

      3.样品浓度:RNA样品≥100 ng/μl;

      4.样品纯度:OD 260/OD 280在1.8-2.2之间,OD 260/OD 230≥2,28S/18S≥1,动物样品RIN≥7.0,植物样品RIN≥6.5,RNA无明显降解;

      5.数据量:10M clean reads/样本;

      6.项目运转周期:标准流程的运转周期为约35个工作日;

      7. 若另有疑问欢迎向本公司咨询,我们将竭诚为您服务。

质量承诺

      1.准确可靠的基因表达谱测序结果;

      2.专业权威的表达测序分析报告;

      3.真实的原始实验数据;

      4.详细的实验步骤。