生物信息学

当前位置: 主页 > 技术服务 > 生物信息学 >

服务介绍

转录组重测序      

       转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有mRNA的总和。转录组研究是基因功能及基因结构等研究的基础,通过新一代高通量测序,能够全面快速的获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息,已广泛应用于临床诊断、基础研究和药物研发等领域。

      转录组Resequencing针对的是有参考基因组的物种。用新一代高通量测序技术对某物种的特定组织或细胞进行转录组测序,与参考基因组比较,可以得到基因表达差异、可变剪接、融合基因等遗传调控信息。

      本公司拥有最熟练的转录组测序技术,我们的技术具备以下特点:1. 通量高:每个样品4G以上的数据产出量,海量数据用于分析;2.覆盖度高:能覆盖到几乎所有转录本片段的序列;3.分辨率高:单碱基分辨率;4.检测阈值广:从几个到数十万个拷贝精确计数,可同时鉴定及定量正常和稀有转录本;5.分析有深度:可鉴定RNA编辑、可变剪接、基因融合等转录水平调控现象;6.数字化信号:单核苷酸分辨率的精确度,不存在传统微阵列杂交的模拟信号带来的交叉反应和背景噪音。

服务内容

1.RNA抽提及测序

2.标准信息分析:

    1).对原始数据进行去除接头污染序列及低质量 reads 的处理;

    2).测序评估(比对统计、测序随机性评估、Reads在基因组上的分布);

    3).基因表达注释(基因覆盖度、覆盖深度分布等);

    4).基因差异表达分析(两个或两个以上样品);

    5).差异基因的表达模式聚类分析(需要确定对符合哪些条件的差异表达基因做聚类分析);

    6).差异表达基因GO功能富集分析;

    7).差异表达基因Pathway显著性富集分析;

    8).对基因结构进行优化;

    9).鉴定基因的可变剪接;

    10).新转录本预测及注释;

    11).SNP分析。

3.个性化信息分析:(≥5个样本)

    1).融合基因分析;

    2).基因共表达分析。

服务说明

      1. 样品类型:细胞、新鲜组织或RNA样品;

      2. 样品需求量:细胞样品≥1×107个,动物组织≥1g,植物组织≥2g,RNA≥10 μg;

      3. 样品浓度:RNA样品≥100 ng/μl;

      4. 样品纯度:OD260/OD280在1.8-2.2之间,OD260/OD230≥2,28S/18S≥1,动物样品RIN≥7.0,植物样品RIN≥6.5,RNA无明显降解;

      5. 数据量:6G clean data/样本;

      6. 项目运转周期:标准流程的运转周期为约40个工作日;

      7. 若另有疑问欢迎向本公司咨询,我们将竭诚为您服务。

质量承诺

      1.准确可靠的转录组重测序结果;

      2.专业权威的转录组重测序分析报告;

      3.真实的原始实验数据;

      4.详细的实验步骤。