生物信息学

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服务介绍

Small RNA 深度测序      

       Small RNA是一类长度在20~30nt的RNA分子,主要包括miRNA、siRNA和piRNA等。Small RNA能够调控基因的表达,在细胞的生长、发育、代谢等基础生物学过程中扮演着重要的角色,甚至在癌症等相关疾病形成过程中起着关键的作用。第二代高通量测序技术省去了烦琐的Small RNA克隆文库构建过程,可以一次性产生上百万条Small RNA序列,能够快速鉴定特定条件下表达的已知Small RNA并发现新的Small RNA,同时还可以研究不同条件下Small RNA的表达差异,并可以联合表达谱数据进行关联分析。

       本公司拥有标准化操作实验室、高通量测序技术平台、经验丰富的技术人员和专业的生物信息团队和大型计算机,实验周期短,质量可靠。可以根据合作伙伴要求提供实验方案、解决实验问题、分析实验结果。同时也可以为合作伙伴提供个性化的生物信息分析服务。

服务内容

      1. 原始数据处理;

      2. 数据去杂;

      3. 已知miRNA的注释;

      4. 新miRNA的预测;

      5. miRNA靶基因的预测;

      6. miRNA表达量统计;

      7. miRNA表达差异分析(不少于两个样品);

      8. miRNA表达模式聚类分析;

      9. miRNA与表达谱数据关联分析;

      10.表达差异miRNA靶基因GO富集分析;

      11.差异表达miRNA靶基因Pathway富集分析;

      12.差异表达miRNA靶基因蛋白互作网络分析。

服务说明

1.组织样品:

    1). 动物组织:>2g;

    2). 植物组织:>4g;

    3). 细胞培养:>1*107个;

    4). 血液样品:≥2ml。

2.RNA样品:

    1). 请提供浓度≥ 200ng/μL,总量≥10μg的RNA(单次建库用量为5μg);

    2) .OD260/280介于1.8~2.2之间,OD260/230≥2.0,RIN≥6.5,28S:18S≥1.0,确保RNA无降解;

    3). 送样时请标记清楚样品编号,管口使用Parafilm膜密封;

    4). 样品保存期间切忌反复冻融;

    5). 送样时请使用干冰运输。

3.cDNA样品:

    1). 样品需求量(单次): 建议送样量≥2ug,对于总量≥500ng的样本可以采用风险建库;

    2). 样品浓度: 最低10 ng/ul;

    3). 样品纯度:OD260/280=1.80-2.00,RIN≥6.5;

    4). 样品保存期间切忌反复冻融,送样时请使用干冰运输。

4. 项目运转周期:标准流程的运转周期为约40个工作日;

5. 若另有疑问欢迎向本公司咨询,我们将竭诚为您服务。

质量承诺

      1.准确可靠的 Small RNA 深度测序结果;

      2.专业权威的Small RNA 深度测序分析报告;

      3.真实的原始实验数据;

      4.详细的实验步骤。